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【Opencv】图像分割——区域生长

1 环境

  • Python 3.8.8
  • PyCharm 2021
  • opencv-python

2 效果

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3 原理

  区域生长的基本思想是将具有相似性质的像素集合起来构成区域。具体先对每个需要分割的区域找一个种子像素作为生长的起点,然后将种子像素周围邻域中与种子像素具有相同或相似性质的像素(根据某种事先确定的生长或相似准则来判定)合并到种子像素所在的区域中。将这些新像素当做新的种子像素继续进行上面的过程,直到再没有满足条件的像素可被包括进来,这样,一个区域就长成了。
  区域生长的算法实现:

  • 根据图像的不同应用选择一个或一组种子,它或者是最亮或最暗的点,或者是位于点簇中心的点,当然也可以手动选择种子点。
  • 选择一个描述符(条件),常见的有基于区域灰度差、基于区域灰度分布统计性质。
  • 从该种子开始向外扩张,首先把种子像素加入结果集合,然后不断将与集合中各个像素连通、且满足描述符的像素加入集合。
  • 上一过程进行到不再有满足条件的新结点加入集合为止。

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4 案例

  本次案例采用了一张医学图像,为肺部 CT 图像,提取肺的轮廓以判断肺的健康性。

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实现的主要流程如下:

  • 读入CT图片,让图片和鼠标进行交互,在三个位置进行左击鼠标生成三个红点,保存每次点击时的 $(y,x)$ 到开始的 $seeds$ 中,完成 $seeds$ 初始化。完成此过程的为 $cv2.setMouseCallback()$。
  • 以上面步骤得到的 $seeds$ 进行区域生长,创建与原 $CT$ 图大小相同的空白图 $seedMark$,根据初始化的种子点的坐标在 $seedMark$ 标记为 $255$。在定义种子点的八领域坐标,当种子与其八邻域的像素差大于 $6$ 且之前在 $seedMark$ 没有被标记过时,则不合并,反之将其与种子进行合并,方式为令 $seedMark$ 的对应坐标的像素为 $255$,并将其存入种子队列作为下次生长时的种子,将当前种子点从种子队列中去除。
  • 输入 $q$ 回车结束交互,效果展示。

代码:

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import cv2 as cv
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from collections import deque

# 计算种子点和其领域的像素值之差
def getGrayDiff(gray, current_seed, tmp_seed):
return abs(int(gray[current_seed[0], current_seed[1]]) - int(gray[tmp_seed[0], tmp_seed[1]]))

# 区域生长算法
def regional_growth(gray, seeds):
#八领域
connects = [(-1, -1), (0, -1), (1, -1), (1, 0), \
(1, 1), (0, 1), (-1, 1), (-1, 0)]
seedMark = np.zeros((gray.shape))
height, width = gray.shape
threshold = 6
seedque = deque()
label = 255
seedque.extend(seeds)

while seedque :
#队列具有先进先出的性质。所以要左删
current_seed = seedque.popleft()
seedMark[current_seed[0], current_seed[1]] = label
for i in range(8) :
tmpX = current_seed[0] + connects[i][0]
tmpY = current_seed[1] + connects[i][1]
#处理边界情况
if tmpX < 0 or tmpY < 0 or tmpX >= height or tmpY >= width :
continue

grayDiff = getGrayDiff(gray, current_seed, (tmpX, tmpY))
if grayDiff < threshold and seedMark[tmpX, tmpY] != label :
seedque.append((tmpX, tmpY))
seedMark[tmpX, tmpY] = label
return seedMark

#交互函数
def Event_Mouse(event, x, y, flags, param) :
#左击鼠标
if event == cv.EVENT_LBUTTONDOWN :
#添加种子
seeds.append((y, x))
#画实心点
cv.circle(img, center = (x, y), radius = 2,
color = (0, 0, 255), thickness = -1)

def Region_Grow(img):
cv.namedWindow('img')
cv.setMouseCallback('img', Event_Mouse)
cv.imshow('img', img)

while True :
cv.imshow('img', img)
if cv.waitKey(1) & 0xFF == ord('q') :
break
cv.destroyAllWindows()


CT = cv.imread('images/CT.png', 1)
seedMark = np.uint8(regional_growth(cv.cvtColor(CT, cv.COLOR_BGR2GRAY), seeds))

cv.imshow('seedMark', seedMark)
cv.waitKey(0)

plt.figure(figsize=(12, 4))
plt.subplot(131), plt.imshow(cv.cvtColor(CT, cv.COLOR_BGR2RGB))
plt.axis('off'), plt.title(f'$input\_image$')
plt.subplot(132), plt.imshow(cv.cvtColor(img, cv.COLOR_BGR2RGB))
plt.axis('off'), plt.title(f'$seeds\_image$')
plt.subplot(133), plt.imshow(seedMark, cmap='gray', vmin = 0, vmax = 255)
plt.axis('off'), plt.title(f'$segmented\_image$')
plt.tight_layout()
plt.show()

if __name__ == '__main__':
img = cv.imread('./images/CT.png')
seeds = []
Region_Grow(img)

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